Η Σάμος κατά την αρχαιότητα ανάδειξε μεγάλο αριθμό διαπρεπών όχι μόνο ανδρών αλλά και γυναικών, σ' όλους τους τομείς του πνεύματος, με πρώτο τον Πυθαγόρα, τον μεγαλύτερο φιλόσοφο των αιώνων. Σαμιώτες επίσης ήταν ο Αρίσταρχος που πολλούς αιώνες πριν τον Κοπέρνικο διατύπωσε το ηλιοκεντρικό σύστημα, ο Αγάθαρκος, μεγάλος ζωγράφος που πρώτος ασχολήθηκε με τη σκηνογραφία και την προοπτική, ο Θεόδωρος, μεγάλος καλλιτέχνης και αρχιτέκτονας, ο Αίσωπος, ο γνωστός μυθοποιός, η Δαμώ, φιλόσοφος, κόρη του Πυθαγόρα, ο Κωλαίος, που πρώτος ταξίδεψε στον Ατλαντικό και πολλοί άλλοι.

Το  Πυθαγόρειο, που άρχισε να αναπτύσσεται από τα μέσα του 19ου αιώνα, είναι χτισμένο πάνω στα ερείπια της αρχαίας πόλης της Σάμου και μέσα στο λιμάνι του, υπάρχουν υπολείμματα από τις λιμενικές εγκαταστάσεις του αρχαίου τεχνητού λιμανιού της. Σε πολλά σημεία σώζονται τμήματα των αρχαίων τειχών, που προστάτευαν την πόλη, τα ερείπια των ανακτόρων του Πολυκράτη, τα Ρωμαϊκά λουτρά και πολλά άλλα. Το σπουδαιότερο, όμως από όλα, είναι το Ευπαλίνειο, ή αμφίστομο λεγόμενο όρυγμα. Αυτό έχει μήκος 1026 μέτρα και διαπέρνα το βουνό που βρίσκεται πάνω από το Πυθαγόρειο και έχει ύψος  246 μέτρα. Η σπουδαιότητα του έργου, είναι στο ότι άρχισαν να εργάζονται και από τις δύο πλευρές του βουνού και συναντήθηκαν στο μέσο με πολύ μικρή διαφορά. Σκοπός του έργου ήταν η ύδρευση της πόλεως και σχεδιάστηκε από τον αρχιτέκτονα Ευπαλίνο, από τα Μέγαρα. Σε μικρή απόσταση, βρίσκεται η  Σπηλιανή, πρόκειται για μια μικρή εκκλησία μέσα σε ένα μεγάλο σπήλαιο και είναι αφιερωμένος, προς τιμή των Εσοδειών της  Θεοτόκου. Έξω από την σπηλιά υπάρχει εκκλησία του Αγίου Γεωργίου και μερικά κελιά. Μέσα στο Πυθαγόρειο, βρίσκεται και το κάστρο του Λυκούργου, που κατασκευάστηκε κατά την περίοδο της επανάστασης του 1821 και σε μικρή απόσταση βρίσκεται το αεροδρόμιο της Σάμου.
Το Πυθαγόρειο είναι πολύ ανεπτυγμένο τουριστικά και έχει μεγάλη τουριστική υποδομή.  Έχει 1579 κατοίκους που όλοι σχεδόν ασχολούνται με τον τουρισμό.